好的，我已经做到了。这有点hacky，但是对于我的用例来说效果很好。
要点是使用ModuleFinder查找所有导入的模块，过滤掉所有系统模块，编译并压缩它们。
不幸的是，我的代码杂乱无章，与这个问题没有任何关系，因此我无法粘贴一个工作程序，仅粘贴一些片段：
zipfile = ZipFile(os.path.join(dest_dir, zip_name), 'w', ZIP_DEFLATED)
sys.path.insert(0, '.')
finder = ModuleFinder()
finder.run_script(source_name)
for name, mod in finder.modules.iteritems():
filename = mod.__file__
if filename is None:
continue
if "python" in filename.lower():
continue
subprocess.call('"%s" -OO -m py_compile "%s"' % (python_exe, filename))
zipfile.write(filename, dest_path)
602392714
清零编程群