你已经在说明问题了：
我尚未修改任何VM选项。
由于JavaFX 11不再是JDK的一部分，因此你必须从此处使用JavaFX SDK（如你所做的那样），或者使用Maven / Gradle从Maven Central检索JavaFX模块。
然后，你需要将SDK添加为库，以便IntelliJ可以找到JavaFX类。
但是，一旦做到了这一点，并且考虑到JavaFX jar是模块，那么你仍然需要做两件事：
根据你的IntelliJ输出，它在默认情况下添加javafx.graphics和javafx.base：
--add-modules javafx.base,javafx.graphics
-p /usr/lib/jvm/javafx-sdk-11.0.2/lib/javafx.base.jar
:/usr/lib/jvm/javafx-sdk-11.0.2/lib/javafx.graphics.jar
（请注意-p与相同–module-path）
这说明了为什么你的项目在第一种情况下运行，即当你没有将控件添加到场景中时，仅运行StackPane属于javafx.graphics 模块的控件，而在添加时添加了Label属于javafx.controls 模块的控件时，失败并显示已发布的异常。
已经说过很多次了：你需要为项目设置所需的VM选项。
首先阅读https://openjfx.io/openjfx-docs/上的文档，包括IntelliJ文档，IDE的非模块化项目部分。并阅读第4部分。添加VM选项。
因此，单击运行->编辑配置，然后添加：
-p /usr/lib/jvm/javafx-sdk-11.0.2/lib --add-modules javafx.controls
应用并运行，该问题将得到解决。
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清零编程群